Ouvert en 1964 près du château d'Iga Ueno, le musée ninja est consacré à l’histoire du ninjutsu. Son directeur honoraire est Jinichi Kawakami, fondateur de l'école Banke Shinobinoden, 21e chef du ninjutsu Iga-ryū et dernier héritier de la tradition.
L’institution culturelle a été victime d’un cambriolage dans la nuit du 16 au 17 août, lorsque son entrée a été forcée à l'aide d'un pied-de-biche tôt le matin et son coffre-fort (pesant pas moins de 150 kg !) emporté. Selon les autorités, le vol était très planifié et n’aurait duré que trois minutes.
Les propriétaires ont déclaré que le coffre-fort contenait un million de yens, soit environ 8 000 euros, la recette du week-end qui venait de se terminer. Isolé en pleine forêt, le bâtiment est plutôt propice à ce genre d’effraction. Les caméras de sécurité du musée montrent une voiture arrivant vers le bâtiment, un homme sortir du côté passager et tourner la caméra vers le sol. La police a été appelée après le déclenchement de l’alarme de sécurité, à 1h30.
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Aucune pièce exposée dans le musée ne manque à l’appel. La collection comprend des écrits anciens relatant l'art du ninjutsu ainsi que diverses armes ninjas. L'armement et les techniques employés autrefois par ces mercenaires de l’ombre sont présentés à laide de maquettes, de reconstitutions et de films. Le musée possède aujourd’hui plus de 400 objets ninjas, dont des shurikens historiques réellement utilisés.
Il existe encore quelques écoles ninja dans le monde, en particulier dans le Bujinkan, le Genbukan et le Jinenkan, bien que leurs bases d'enseignement ne soient pas rigoureusement identiques et que leur approche varie légèrement.
